Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms