Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOGA3Q5TF21 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms