Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP2LQ5T4T6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2LQ5T4T6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms