Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms