Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CC2D1BQ5T0F9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D1BQ5T0F9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms