Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms