Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATAT1Q5SQI0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAT1Q5SQI0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms