Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR44Q5JSH3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms