Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGO2Q562F6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms