Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALFQ53S48 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms