Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms