Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms