Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms