Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIAA1644Q3SXP7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms