Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICBQ29980 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICBQ29980 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICBQ29980 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICBQ29980 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICBQ29980 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICBQ29980 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms