Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q1T7F1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q1T7F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q1T7F1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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