Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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