Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCSK7Q16549 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms