Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SSX1Q16384 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX1Q16384 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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