Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC6Q16204 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC6Q16204 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC6Q16204 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC6Q16204 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC6Q16204 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms