Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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