Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNHIT3Q15649 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms