Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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