Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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