Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNQ14247 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNQ14247 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms