Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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