Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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