Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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