Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX3Q13761 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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