Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMB3Q13751 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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