Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FOXE3Q13461 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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