Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTA1Q13424 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTA1Q13424 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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