Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE3BQ13370 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PDE3BQ13370 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE3BQ13370 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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