Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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