Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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