Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CGNL1Q0VF96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CGNL1Q0VF96 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms