Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPAL4Q0D2K0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms