Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC8Q09428 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC8Q09428 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC8Q09428 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms