Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YDR029W	YDR029W	315 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YPL068C	YPL068C	882 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	RRG8	YPR116W	834 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	APC2	YLR127C	2562 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	COG2	YGR120C	789 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YOR283W	YOR283W	693 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	TRZ1	YKR079C	2517 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	VPS74	YDR372C	1038 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YMR31	YFR049W	372 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	CSE4	YKL049C	690 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	NYV1	YLR093C	762 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	OST2	YOR103C	393 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	VID24	YBR105C	1089 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	COG3	YER157W	2406 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	AFR1	YDR085C	1863 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	ARF3	YOR094W	552 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	NPR1	YNL183C	2373 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YDR210W-A	YDR210W-A	1317 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	PEA2	YER149C	1263 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SCEI	Q0160	708 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	AYR1	YIL124W	894 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YLR202C	YLR202C	327 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YMR144W	YMR144W	1029 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YMR187C	YMR187C	1296 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	APL5	YPL195W	2799 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	DUG2	YBR281C	2637 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SAK1	YER129W	3429 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YDL187C	YDL187C	330 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	GET1	YGL020C	708 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	ERV1	YGR029W	570 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	HSP10	YOR020C	321 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	YPR172W	YPR172W	603 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	SIR3	YLR442C	2937 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	RRI2	YOL117W	1938 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	DAL5	YJR152W	1632 nt		2.71	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	STE11	YLR362W	2154 nt		2.71	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.71	□□□□□ -1.97
MRD1	Q06106	CSF1	YLR087C	8877 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	CRD1	YDL142C	852 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	IRC2	YDR112W	309 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	AAD16	YFL057C	459 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	VPS20	YMR077C	666 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YOL150C	YOL150C	312 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	VTC1	YER072W	390 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	APQ13	YJL075C	417 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	RLP24	YLR009W	600 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	ESF2	YNR054C	951 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	PEP12	YOR036W	867 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YBR071W	YBR071W	636 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YDL009C	YDL009C	324 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	CHZ1	YER030W	462 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	IST3	YIR005W	447 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	RBL2	YOR265W	321 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YOR364W	YOR364W	369 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	ATP3	YBR039W	936 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	ALG14	YBR070C	714 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	FIR1	YER032W	2631 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	snR84	snR84	550 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YER189W	YER189W	369 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YIL029C	YIL029C	429 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	HRI1	YLR301W	735 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.68	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	SCD5	YOR329C	2619 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	RTS3	YGR161C	792 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	DFG10	YIL049W	762 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	STE18	YJR086W	333 nt		2.67	□□□□□ -1.98
MRD1	Q06106	MEI5	YPL121C	669 nt		2.67	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms