Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A11Q02978 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms