Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLOD1Q02809 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms