Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms