Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPCQ01831 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPCQ01831 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPCQ01831 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPCQ01831 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPCQ01831 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XPCQ01831 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
XPCQ01831 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XPCQ01831 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms