Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD1P98174 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD1P98174 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGD1P98174 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGD1P98174 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms