Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NOMO3P69849 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOMO3P69849 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms