Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM4P67936 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM4P67936 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPM4P67936 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms