Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2HP62256 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms