Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP11P59045 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms