Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3BP58499 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms