Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms